微波治疗仪在使用过程中可能会出现以下几个方面的副作用，需要引起注意：
1.体内或被照射部位有金属物：如果身体内部有金属物或者在照射部位存在金属仪器，微波治疗可能会导致金属发热，进而引起金属物的损伤或深层软组织的烧伤。
2.局部皮肤和软组织烧伤：微波治疗可能导致局部皮肤和软组织产生过多的热量，从而导致局部烧伤。这通常发生在治疗过程中或治疗环境不当的情况下。
3.凝血功能异常或易出血病人的风险：对于凝血功能较差或容易出血的患者，进行微波治疗可能增加血管破裂出血的风险，进而导致皮下软组织血肿的形成。
需要强调的是，这些副作用并不是微波治疗仪普遍会引发的，而是在特定情况下可能出现的风险。在接受微波治疗之前，应咨询医生了解自身情况是否适合此种治疗方法，并遵循医生的指导和建议。