空腹喝蜂蜜水一般能清肠排毒，但也可能引发不适。
喝蜂蜜水能够为人体的大脑神经元提供充足的营养，含有果糖和葡萄糖，容易被人体迅速吸收，补充身体能量。如果是由于肠道毒素积聚而引起的长期便秘，可以在空腹时饮用蜂蜜水，达到排毒清肠的效果。然而，由于蜂蜜水中的糖分含量较高，会导致胃酸分泌增多，对胃粘膜会产生较大的损害，所以如果经常空腹饮用蜂蜜水，会导致胃、十二指肠溃疡的发生。
可以在喝蜂蜜水前1小时内饮用温水，也可以在餐后1小时内饮用蜂蜜水。