人工麝香与天然麝香之间的差别，主要在于形成方式及香味，药性等方面。
天然麝香以麝香酮为主要原料，但其所含原料不详，而且天然麝香酮原料均为动物纯天然有机原料。且人工化学合成麝香多不出动物体内，缺乏最起码生活性治疗范围，治疗效果不及天然麝香。
人造麝香中，以棕色粉末状光泽为主，天然麝香则为黑褐色颗粒状固体，同样带有浓郁气味儿。
用麝香时，可根据需要选用人工麝香或纯天然麝香，平时需要遵医嘱使用，避免擅自使用导致身体不适。