太子参一般无明显副作用，太子参副作用多与剂量使用不合适有关，剂量过大会导致上火。使用方法不恰当，非但没有效果，还会危害人体。
1、剂量使用不合适：太子参是滋补药品，补益力度虽不如人参和红参，但是补益药都有一个共性，即吃多了易上火，而滋腻了反而造成里热内生，口干舌燥心烦。所以，需要注意的是不能每次吃太多的太子参。
2、使用方法不恰当：中药十八反中的各类参和藜芦是对立的，配伍使用会损害药效，尽管太子参和人参等药植物的产地不一样，但是要慎重，太子参仍不适合和藜芦配伍使用；在此基础上，太子参不宜用于表实邪盛的孕妇，体质强壮的妇女，及湿邪困脾的妇女。