厦门有许多医疗美容机构和皮肤科医院，您可以按以下方式选择祛痘印的机构：
1. 查询和比较不同机构的服务和价格，看看哪家机构的评价和口碑更好。
2. 查看机构的资质和医生的职业背景，以确保机构和医生的专业能力和资质。
3. 前往机构亲自咨询，看看医生的态度、专业水平以及技术方案是否合适。
4. 注意机构是否有中华人民共和国卫生部门颁发的医疗美容机构执业证书，以及是否有相关的安全保障措施。
基于以上几点，厦门市中山医院皮肤科、中华皮肤病学会会员单位厦门市中药皮肤病研究所等区别也是不错的选择，希望能够帮到您。