银耳根部黄的部分不建议吃，因为即使根部未变质，此部分的营养和口感也比较差，而整朵银耳是否能吃应视具体情况而定。银耳的根部呈黄色，主要是因为根部掺杂了泥土、杂质，也有可能是由于自然氧化引起的，所以并不有毒。如果没有坏掉的征兆，就可以把发黄的银耳去掉，这样不仅不会影响口感，还能帮助形成胶质。
当银耳根部发黄，出现朵型残缺、腐臭味等，说明银耳已经发生了变质，可能会产生大量的细菌和有害物质。在这种情况下，就算银耳的上半部没有任何问题，也有可能被病菌感染，所以不能食用整个银耳。为了避免引起食物中毒，引起头晕、恶心、呕吐、腹部疼痛、腹泻等不良反应，建议立即扔掉。