磷虾油副作用包括引起口腔异味和胃肠不适以及导致过敏，要注意别吃得太多。
1、引起口腔异味：磷虾油在使用过程中，会因刺激胃肠道而使口腔产生异味。
2、胃肠不适：吃磷虾油作为食品原料可以吃到食物中，富含蛋白质、维生素、脂肪和其他多种营养物质，适当吃对人体有益，但若吃得太多，会刺激胃肠黏膜，导致恶心、呕吐、腹痛和腹泻，因此不宜过多。
3、导致过敏：过敏体质者如吃磷虾油可导致皮肤过敏，皮肤瘙痒、红疹、红斑，必须谨慎。
除上述副作用外，还可降低血液凝固等，通常必须适量应用。