扁桃体一边大一边小可能是先天发育异常、扁桃体炎、扁桃体肥大等因素导致的，建议积极治疗。
1、先天发育异常：在先天发育的时候，如果发生了一些异常的突变，就会引起扁桃体一侧大一侧小。
2、扁桃体炎：当患者在日常生活中，由于自身的免疫力较低，并且经常有扁桃体炎，在受到炎症的刺激后，就会引起扁桃体的形态变化，从而造成扁桃体的大小不一致。
3、扁桃体肥大：扁桃体肥大的原因是扁桃体的肿大，使得扁桃体的大小发生变化。