扁桃体结石口臭一般可以通过日常护理、手术治疗等方式进行治疗。
病情轻微的人可以在饭前、饭前和睡觉前，用含生理盐水或者是漱口液来清洗扁桃体上的微小结石，这样就能消除口臭。
如果出现了长期的炎症刺激或者是溃疡，或者是出现了扁桃体结石，需要找专业的医师进行治疗，可以使用钳子或者是棉花棒来进行治疗。
除此之外，由于慢性扁桃体炎引起的干酪样物潴留也会导致出现扁桃体结石，可以口服一些中成药来降低干酪样物的生成。
对于有复发的、清除结石无效的病人，可采用扁桃腺摘除手术治疗。