情感障碍症的发病原因可能与生理因素有关，也可能与5-羟色胺（5-HT）活性降低、去甲肾上腺素活性下降等有关。
1、生理因素：神经生化、心理药理、神经递质代谢等方面的研究，发现病人的中枢神经递质代谢及相关受体的功能发生了变化，脑神经突触间隙内的5-羟色胺等神经递质的水平也出现了明显的变化。
2、5-羟色胺（5-HT）活性降低：可作为双向情感障碍的基本特征，并被认为是双向情感障碍的易感性指标。
3、去甲肾上腺素活性下降：与抑郁症的发生相关，而去甲肾上腺素活性上升则与狂躁相关。