黑色素痣的形成源于胚胎发育过程中基因突变的随机性，这种突变可能导致黑色素细胞的生长能力增强，从而在局部形成黑色素痣。
如果没有这个因素的话，那么黑色素细胞可以继续进行增殖，但是它不会发生分化为更多的组织器官和功能，这就是所谓的黑素生成障碍问题。
其次，在创伤愈合的过程中，可能会出现黑色素细胞的激活现象，从而导致局部伤口出现黑色素痣的生成。如果皮肤损伤过甚的话，那么就会发生瘢痕增生，从而引发黑痣问题。
第三，过度曝晒于紫外线下也会刺激黑色素细胞的活跃，从而导致黑色素痣的形成。