生殖器疱疹一般不建议自行治疗，建议就医进行治疗。常用的治疗手段有抗病毒治疗、免疫调节治疗、局部治疗及对症治疗。
1.抗病毒治疗：阿昔洛韦通常口服应用，能选择性地抑制病毒复制，降低新损害，缓解痛苦，缩短伤口愈合时间。用药需遵医嘱。
2.免疫调节治疗：gD-2疫苗的使用可减少复发次数，在缓解症状，防止感染方面亦有一定效果。
3.局部治疗：常使用阿昔洛韦乳膏和龙胆紫溶液，对创面有保护作用，防止感染。
4.对症治疗：继发感染应酌情应用抗生素。
上述药物都需要在医生的指导下服用，疑有生殖器疱疹的患者，应及时就诊，并积极的配合医生的治疗，以免耽误病情。