生殖疱疹在初期会有红斑、皮疹丘疹和溃疡，或者烧灼感和瘙痒感，生殖器疱疹是性传播疾病中最常见的疾病之一，其主要原因就是单纯疱疹病毒感染引起皮肤黏膜受到病毒刺激造成损害。
感染生殖器疱疹之后会有几天的潜伏期，之后会在生殖器的皮肤、和黏膜的连接处出现微微的红斑，这个时候的症状通常都会非常的显著。随着疾病的进展，患部渐有红色小颗粒如皮疹、丘疹，有的患部可伴有灼热感和痒感，但其程度轻。1-2天后，病人生殖器的皮肤黏膜上，及周围的组织都会有簇状的小水疱产生，小水疱损伤破裂后，就会在患部形成糜烂，溃疡并伴随着剧痛，溃疡会持续好几天，然后结痂改善。
有的病人早期起病，还会有发烧、头痛、疲乏无力等身体不适。