湿疹与真菌感染的区别在于性质不同，所引起的症状不同，必须要到皮肤科进行皮肤涂片显微检查，同时还要进行血清检测。
1、性质不同：湿疹是一种慢性炎性瘙痒性皮肤病，多由机体的免疫功能异常或全身的疾病所致，如营养障碍、内分泌疾病、慢性感染等，都会造成皮肤屏障功能的损害，而真菌感染则是因为真菌侵入皮肤的浅处或深处，有可能是因为皮肤癣菌、角层癣菌等，也有可能是因为机体的抵抗力降低或菌群失衡所致，也有可能是继发感染。
2、症状不同：湿疹起病较早，可表现为皮肤上有红斑，有大小不一的丘疹或丘疱疹，伴有强烈的瘙痒和烧灼感，当霉菌侵入呼吸道时，可产生凝胶样的粘液，伴有腹泻和肛门周围的白色斑点。