溃疡病的治疗方法会根据其病因和病变部位而有所不同。口腔黏膜溃疡的治疗方法包括抗感染、免疫抑制剂或中药治疗，适量补充B族维生素，以及使用中药如锡类散、西瓜霜等进行治疗。消化系统溃疡的治疗方式包括抑酸药、胃黏膜保护剂、促进愈合类药物以及胃动力药物等，如果患者出现恶心、呕吐和腹胀等症状，提示有胃排空迟缓、胆汁反流，可予胃动力药物。
发现消化性溃疡合并幽门螺杆菌感染，需要进行足疗程的四联疗法。眼角膜溃疡的治疗方法包括针对病原菌进行治疗，以及金霉素、干扰素结膜下注射等配合治疗。严重的患者需要进行板层角膜移植术。