皮脂腺囊肿手术切除后，一般会留下疤痕，具体疤痕程度因人而异，如果切口较大或患者是疤痕体质，建议采取药物治疗、激光或手术治疗。药物治疗可以尝试外用多磺酸粘多糖乳膏、复方肝素钠尿囊素凝胶、积雪苷霜软膏等，这些药物可以促进皮肤胶原蛋白再生和纤维组织重排，从而淡化疤痕。
激光治疗可以通过促使皮肤胶原蛋白再生来淡化疤痕，但需要多次治疗才能完全淡化疤痕。手术治疗可以选择疤痕切除术或者皮肤磨削术，这些手术方法可以改善疤痕外观，但需要注意术后护理，防止感染。