新生儿黑色素痣的形成原因主要有以下两点：
1.人体血清中的微量元素缺乏是导致新生儿黑色素痣的一个重要原因。血清中锌、铜、钙等微量元素的缺乏，会导致黑色素的过度沉淀，从而在皮肤表面形成黑色素痣和胎记。
2.在胎儿发育过程中，皮下的黑色素细胞向表皮层发育迁移时可能受到阻碍，这会导致黑色素细胞滞留在真皮层，无法正常向表皮层迁移，最终导致黑色素痣的形成。这是新生儿黑色素痣的另一个重要成因。
综上所述，新生儿黑色素痣的形成是由血清微量元素缺乏和黑色素细胞发育迁移受阻两大原因共同引起的。充足的微量元素摄入和皮肤细胞正常发育是预防新生儿黑色素痣形成的关键。