生殖疱疹的治疗方法取决于病情的轻重和个体差异，没有绝对的最佳治疗方法。轻度患者可以选择局部治疗，如使用抗病毒药物阿昔洛韦软膏或红霉素软膏。对于重症患者或局部治疗无效的患者，可以考虑口服抗病毒药物，如阿昔洛韦片或盐酸伐昔洛韦片，或者结合阿司匹林或对乙酰氨基酚片进行治疗。
及早治疗是关键，以避免并发症的发生。