匮肾气丸和六味地黄丸的区别，体现在方剂的组成和功效上。匮肾气丸具有温补肾阳的作用，可用于治疗肾阳虚引起的阳痿、早泄、脉沉细等。六味地黄丸是在金匮肾气丸的方子上减去附子、肉桂而组成的，具有滋补肾阴的作用，用于肾阴不足的头晕目眩、失眠等。