肠镜能检查发现的疾病主要包括黏膜病变和黏膜下隆起样病变，黏膜病变包括黏膜腺细胞癌变形成的腺癌、黏膜形成的溃疡，还有炎症、血管发育异常等病变。黏膜下病变包括间质瘤、平滑肌瘤，这些病变随着它的生长可以向黏膜内隆起，通过肠镜可以看到一个隆起性的病变，表面黏膜可能是正常的，但是能看到底下有隆起，所以肠镜检查能发现这些疾病。