肛周脓肿有时是急性直肠炎症或慢性肛瘘的表现，主要的区别是肛周脓肿会导致病人体温升高，还会使得病人身体打寒战，或者是导致病人身体搞弱以及发生中毒现象，但是肛瘘往往不具备这些现象；毛囊炎是一种与肛周脓肿容易混淆的疾病；肛周脓肿有些时候可能与化脓性汗腺炎相互混淆，肛周脓肿是一种直肠炎从身体内部向外面逐渐蔓延的一种，而化脓性汗腺炎是人体的大汗腺被感染之后在人的皮下组织或者是皮内组织产生的一种化脓性的炎症。