肛瘘的原因：肛周脓肿自行溃破或切开引流后造成。直肠肛门损伤细菌侵入伤口即可引起。肛门裂反复感染，会阴部手术，内痔注射误入肌层或手术后感染，产后会阴缝合后感染，前列腺、尿道手术后感染等，均可波及肛门直肠引起脓肿及瘘；结核。溃疡性大肠炎。直肠肛管癌；淋巴肉芽肿，放射菌病，尾骶骨髓炎，直肠、乙状结肠憩室炎等也可引起肛门直肠脓肿。