虽然手术能治疗肛乳头瘤，但要严格掌握其手术时机，要根据其病情不同时期的发展采用相应的综合治疗方法。对早期的采用一些预防性的治疗，对不能手术的病人在治疗的同时配合中药灌肠治疗以提高疗效。在手术当中要注意保护肛管皮肤尽量减少对肛管皮肤的损伤避免后遗症的发生。