肛门瘙痒难耐的原因是寄生虫感染，这情况以蛲虫感染最为常见，真菌感染，肛门周围的皮肤经常处于潮湿状态，是真菌感染的多发部位。感染该部位的真菌多以白色念珠菌为主，病毒感染，常见的尖锐湿疣、传染性软疣等疾病都是病毒感染造成的。这些疾病也可引起肛门瘙痒。