大多数肛瘘是由肛管周围的脓肿引起的，所以内孔主要位于齿状线的肛窦内，脓肿破裂或打开引流区域形成一个位于肛门周围皮肤上的外部孔，当肛瘘分泌物较多时，应经常更换内衣裤，清洗后暴露在阳光下，肛带还可以用来保护肛门，避免内衣被过度污染，肛门也应定期清洗。