肛窦炎主要症状表现在常有肛内轻微隐痛坠胀或不适感或肛腺分泌减少，肛管干涩、排便不畅等。急性发作期常有排便疼痛、分泌物多、手纸偶然带脓血、烧灼不适肛门坠胀等。如果肛门括约肌受炎性刺激可引起括约肌轻度或中度痉挛性收缩，常有短时间阵发性钝痛或疼痛持续数小时。