肛瘘初期通过手术治疗好。根据自身实际情况选择适合自己的手术治疗方法。可以选择切开引流。如果是合并感染，此时身体还有其他因素影响手术治疗，可以通过切开引流法治疗，主要方法是在感染灶表面切开一个小口进行引流。可以置管或挂线引流。这种治疗方法比较适合高位瘘或多瘘管的复杂瘘的人。还可以采用肛瘘切开术。这是一种治疗肛瘘采用的最经典的手术方法，大部分低位肛瘘者都可以采用这种手术方法治疗。