肛瘘有间歇期和发作期。间歇期会完全没有症状，可以不用药。发作期出现流脓、红肿、疼痛等症状，如果不能马上手术，也可以药物治疗暂时缓解症状。外治用消肿止痛洗剂坐浴。急性发作期可以使用抗生素，但不要超过一周。如果特别严重需要手术治疗。