瘘主要是有以下临床症状，流脓是主要症状，脓液多少与瘘管长短，多少有关，新生瘘管流脓较多，分泌物刺激皮肤而瘙痒不适，肛瘘外口流出少量脓性、血性、粘液性分泌物为主要症状。疼痛瘘管通畅无炎症时常不感疼痛，只感觉局部发胀和不适，行走时加重。当瘘管感染或脓液排出不畅而肿胀发炎时，可引起疼痛，瘙痒由于脓液不断刺激肛周皮肤，常感觉瘙痒，有时形成湿疹。