肛周囊肿的早期症状有周身不适、发热寒战、体温升高等全身中毒症状。局部见肛门一侧肿胀、发红、灼痛、跳痛、压痛、坐卧不安，活动和排便时痛加重，有排尿困难等。低位脓肿出现剧烈肛门疼痛，且这种疼痛持续不减。直肠周围脓肿最主要表现是局部坠胀和便意感，发热常见，最高可超过40°。