肛门闭锁的发生是正常胚胎发育期发生障碍的结果。目前治疗的方法有很多种，其手术方法有等多种术式，如：Nicolai一Rehbein的改良手术，或Stephens的骶会阴肛门成形术及Pena的后矢状入路肛门成形术等各有其特点，效果也各异。另外肛门闭锁术后护理非常重要。术后最常见的问题是肛门狭窄。伤口愈合会使肛门越来越小，需要进行扩肛治疗。