少数的肛周脓肿可以使用抗生素热水坐浴以及局部理疗等方法来进行该病的治疗，这种方法主要针对于病情较轻的肛周脓肿。还可以进行单纯性肛周脓肿的治疗，可以在截石位或者是侧卧下，采用局部麻醉或者是腰麻在脓肿的部位，需要进行放射状的切口，在放出脓液之后需要伸入食指，从而探查脓腔大小分开的间隔，必要的时候要将切口的边缘皮肤进行少许的切开，从而利于引流，最后在使用药物纱条放入到脓腔做引流处理。