肛周囊肿是根据临床表现来判断的，该病在病情发作时常表现为疼痛。如果盆膈肌下方脓肿位置较浅，疼痛就较重且为跳痛，影响行走和下坐。如果盆膈肌上方脓肿位置较深，疼痛就较轻，且多为胀痛。排便时疼痛加剧，可伴排尿困难。肛周囊肿症状还表现为寒战、发热、头痛、周身不适、脉速等。通过这些症状就可以判断是否得了肛周囊肿。