肛门水肿分泌物较少，形成肛瘘后分泌物多为脓性物，伴有臭味；痔疮一般肛门较少有分泌物，当内痔严重脱出时可能有分泌物出现，但是分泌物多稀薄；肛门水肿是由于肠道菌进入肛窦致其发炎；而痔疮是由于便秘、长期饮酒、进食大量刺激性食物和久坐久立等因素诱发。除了疼痛外，肛门水肿还有另一症状，就是发热，最高能超过40°；而痔疮无发热症状，却伴有便血的症状。