肛周囊肿开始时先感到肛门部出现一个小硬块，坠胀疼痛，肛门部难受，继则出现红肿，局部皮肤发烫，疼痛加重，全身可出现倦怠不适、食欲不振、坐卧不安、夜寐不宁的体温升高等症状。深部脓肿还会引起会阴部和尾骶部胀痛，出现恶寒发热全身中毒症状。