腰部距离脊椎5公分左疼的原因可能是脊椎病变所致的腰背痛常见于类风湿性脊椎炎、骨质增生症、结核性脊椎炎、脊椎外伤及椎间盘脱出等。还可能是因为内脏疾病所致的腰背痛常见于肾炎、泌尿系感染、泌尿系结石、胆囊炎、胆囊结石、胰腺炎、胃及十二指肠球部溃疡。