近视眼手术的后遗症包括：
1. 眼疼：手术后可能会出现不适感、轻微疼痛、刺痛及干涩感，这些不适体验通常在一两天即可消失。
2. 视力不稳定：术后可能会出现视力波动、模糊甚至失明的现象（罕见），这主要与角膜愈合有关，一般会随愈合而改善，但也有极少数患者可能会一直存在。
3. 干眼症：角膜切割后角膜感受神经受到了破坏，从而引起干眼症；此外术后使用的麻醉、角膜吸盘等也可能损伤角膜表层，导致干眼症。对于干眼症患者不推荐进行角膜手术。
4. 眼压升高：手术后可能会导致眼内压力升高，这种情况在手术前就应该排除。如果出现眼压急剧升高，可能会导致青光眼的发生。
5. 角膜瘢痕：极少数患者会出现角膜瘢痕，但一般不会影响视力。
不过，需要强调的是，近视眼手术作为一项比较安全的手术，后遗症都属于极少数，如果手术前和术后遵循专业医生的指导和注意事项，合理保养和恢复，一般不会发生上述副作用。