预防巧克力囊肿复发，多数是使用药物使患者在一段时间内停经，激素保持在最低水平，巧克力囊肿没有激素供养而自己萎缩，常用药物是屈螺酮炔雌醇片，屈螺酮炔雌醇片(Ⅱ)。巧克力囊肿的医学专业名词称为子宫内膜异位症，就是说本来应该长在子宫，腔内的内膜长在了子宫腔以外的部位，其中长在卵巢上的内膜周期性出血形成的包块就叫巧克力囊肿。因此如果能让女性月经停止，每个月不出现内膜出血，自然巧克力囊肿也不会形成，称之为假孕疗法。