如果不可逆的子宫内膜薄存在，常常会引起不孕，这就像土地和种子的问题，如果卵子正常，子宫内膜薄常常是土地比较贫瘠，如果土地贫瘠就不能很好的生长庄稼，因此子宫内膜薄可能会造成不孕或者胚胎发育不好，或者胚胎生长受限等。
子宫内膜薄这一诊断是否成立，要看检查的时间、自觉症状以及测定的方法。一般在月经刚刚结束时子宫内膜最薄，而在月经即将来潮时，子宫内膜常常最厚。出现子宫内膜变薄常常有多种原因，可能是卵巢功能异常，也可能由于多次的宫腔操作，导致了子宫内膜基底层的破坏，这时候会出现月经量减少等症状。子宫内膜薄如果是卵巢功能异常导致，通过调整卵巢功能完全可以恢复。如果是因为多次的宫腔操作，如流产等导致子宫内膜薄，常常不可以恢复。