卵巢主要分泌是两种激素，一个是雌激素；另一个是孕激素。雌激素和孕激素的作用有的时候是相互辅助的作用，有的时候是相互拮抗的作用：第一点，雌激素可以使人变瘦，变得更有肌肉，孕激素实际上可以使人变胖。
第二点，雌激素有时有使子宫内膜增长的作用，孕激素有使子宫内膜变成分泌期的作用，同时孕激素也可以对抗雌激素使子宫内膜的增长作用，使子宫内膜变得萎缩，这是孕激素的作用。所以时常在子宫肌瘤、子宫内膜癌、子宫内膜增生、子宫内膜息肉这些疾病中，会用到孕激素这种保护性的作用。
孕激素还有一个作用就是怀孕早期胚胎的营养作用，这是孕激素特有的作用。怀孕早期三个月之内，胚胎的营养主要靠卵巢黄体分泌的孕酮，所以孕激素在胚胎早期的营养上，起了一个决定性作用，如果孕激素不足，有可能会出现胚胎停止发育的情况。