男性输精管结扎术后，手术部位会留有不同程度的瘢痕，男性双侧输精管结扎手术切口部位位于双侧阴囊上部，像其他手术一样，手术部位的切口愈合后会留有不同程度的瘢痕。
如果手术后切口一期愈合，切口瘢痕比较小。如果合并感染，手术瘢痕会比较大，但由于阴囊皮肤皱褶比较多，手术部位的瘢痕比较隐匿，从外观上看不明显。