巧克力囊肿一般发生癌变后，其早期症状并不明显，部分患者可有下腹部疼痛、阴道不规则流血、月经紊乱，以及局部的压迫症状。
巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种表现，早期出血量少，症状比较轻微。但是如果出现以上症状，患者应该高度重视，及时进行治疗，多采用手术切除。同时也应注意肿瘤标志物的定期复查，防止肿瘤发生。