妊娠合并尿石症的治疗，需根据妊娠期有无感染而定，治疗原则是首选保守治疗、抗感染治疗和对症治疗，保守治疗失败者需进行手术治疗。
一、保守治疗
水化疗法，即大量饮水，每日尿量保持在2000ml以上，这样每日饮水量需2500ml~4000ml。一方面，可以增加尿量，缩短游离晶体颗粒在尿路中的停滞时间，促进较小的结石自行排出。另一方面，可以降低尿液中钙离子及尿酸浓度，从而降低结石的形成几率。
二、药物治疗
1、黄体酮：黄体酮具有解除输尿管平滑肌痉挛的作用，可舒张子宫平滑肌，对胎儿无不良影响，是治疗妊娠合并肾绞痛的常用药物。
2、阿托品：疼痛剧烈者可以止痛。不能过量使用，以免出现口干、眼花。
3、青霉素：青霉素或红霉素类抗感染，减轻尿路水肿，利于结石的松动与排出。
三、手术治疗
输尿管镜下碎石对妊娠期顽固肾绞痛有效，还需要做麻醉，有一定风险。输尿管镜下碎石仅限于输尿管内，手术创伤对孕妇和胎儿的影响都很小。