通常在药物流产时，前两天服用米非司酮，米非司酮通过竞争孕激素的受体，使得胚胎凋亡，而服用米索前列醇，使子宫出现收缩，然后排出孕囊。每个人服药以后的敏感性是各不相同的，常常在服用药物半小时后，开始出现子宫收缩，子宫收缩会逐渐加重，以致排出胚胎。
常常排胎的过程可以持续2-3小时，或者更长的时间，绝大多数人在六小时之内是可以排胎的。如果超过八小时尚未排胎，或者是排胎不全，就需要进一步处理了，如果根本没有排胎，需要进行清宫。如果排胎以后，有少量的残留，可以继续服药，观察其是否可以排出，如果残留的比较多，也需要进行清宫处理。