女性子宫内膜薄的原因有很多，具体如下：
一、生理性原因，当刚来完月经的时候，由于子宫内膜脱落，这个时候子宫内膜薄，一般是在0.4-0.6cm左右。
二、内分泌失调、卵巢功能的早衰，由于体内激素水平的低下，使得子宫内膜不能够增长，这个时候也会造成子宫内膜薄。
三、子宫内膜受到了损伤，常见的是过多的做人工流产手术、清宫手术，或者是其他一些宫腔手术，会造成子宫内膜功能层的永久损伤，而使得子宫内膜变薄。
四、炎症性疾病，例如子宫内膜炎、宫腔粘连等等。
子宫内膜薄都会引起月经量的减少、月经的不规则，甚至会造成不孕症。