孕妇的结膜炎本身并不会对胎儿产生影响，因为结膜炎的位置处于局部结膜，炎症反应不会波及全身，病原微生物及其有毒代谢物不会经过血液影响到胎儿。
但是，如果孕妇使用抗生素眼药水治疗结膜炎，目前的研究没有明确某类眼药水对胎儿安全，因此孕期结膜炎使用抗生素治疗，或者是抗病毒药物治疗，对胎儿的影响目前尚不明确。