该病临床中主要以消除症状、改善生活质量、控制周期为主，对卵巢功能异常患者进行激素监测和药物治疗，通常可取得较好疗效。
一、药物治疗
1、谷维素：能调整自主神经功能，减少内分泌平衡障碍，改善精神失调症状。对于出现自主神经紊乱患者有良好的疗效，对于精神症状有好转者可长期服用。
2、维生素B6：对谷氨酸代谢有影响，尤其是和氨基酸代谢有密切关系，可用于调整自主神经系统与下丘脑-垂体-卵巢轴的关系。适用于出现头痛、眩晕、记忆力减退、睡眠质量较差的患者改善精神状态，可长期维持使用。
3、锂离子：锂离子能改变神经的兴奋性，具有排钠利尿的作用，对出现水肿的患者有较好的疗效。此类药物只可作为短期治疗，不可用于长期维持治疗。
4、性激素：对于月经失调及生殖器发育不全者可给予性激素治疗，以调整月经和促使生殖器的发育。
二、手术治疗
1、腹腔镜下卵巢打孔术：在腹腔镜下对病变卵巢应用电针或激光打孔，每侧卵巢打孔4个为宜，并且注意打孔深度和避开卵巢门。适用于有生育要求的年轻患者，术后可出现盆腔粘连、卵巢功能低下等症状。
2、卵巢切除术：在腹腔镜下将病变卵巢切除，切断缝扎骨盆漏斗韧带，切断缝扎输卵管及卵巢固有韧带并将残端包埋。适用于无生育要求、年龄较大的患者，可有效防止疾病复发，预防癌症。术后早期可下床活动，避免盆腔器官粘连。
3、卵巢部分切除术：腹腔镜下将病变卵巢部分切除，剩余卵巢组织缝合止血，尽量避免局部电凝术。适用于有生育要求的年轻患者。