1、妇科检查：可通过阴道触诊检查发现子宫后位，活动受限，后壁不平，在子宫骶韧带及子宫直肠陷凹处触及痛性结节及附件区有粘连性包块，即应考虑本病的可能。
2、阴道后穹窿穿刺：此项检查为有创检查，作用是从抽出的液体来判断是否有卵巢巧克力囊肿破裂出血，抽出较黏稠、咖啡色液体是诊断的可靠依据。
3、肿瘤标志物检查：血清癌相关抗原CA125检测有升高，对卵巢巧克力囊肿破裂诊断有帮助。
4、B超、CT、MRI：可发现盆腹腔积液，或发现位于宫旁、卵巢、子宫直肠陷凹、直肠阴道隔及乙状结肠等处有异位灶。