排卵障碍的主要症状会表现为月经周期的推后，甚至还可能导致闭经。由于长时间不排卵，还可能引起无排卵型的功血，这时就可能出现阴道大量出血，出血时间会明显延长，甚至还会出现头晕、乏力、心慌等贫血表现。少部分女性还可能出现阴道出血淋漓不尽，出血颜色是咖啡色或黑色。
1、无排卵性功血：该症状青春期女性最多见，出血间隔时间可长可短，可从几天到数月，甚至1年以上。出血持续时间亦可长可短，常在生活中某些事件如考试、比赛、剧烈运动等后发生。出血量少时仅点滴出血，多时可有大血块，出现严重贫血。长期出血时因盆腔充血而下腹坠胀，乳房受雌激素影响而胀痛，亦可出现面部与四肢水肿。
2、月经不调甚至闭经：排卵障碍也会影响正常月经，排卵障碍较为直接症状是会发生月经失调和闭经。
3、第二性征出现异常：身材高大和第二性征发育不良也是不排卵其中的一个症状，主要是因为中枢神经异常，继而引发性功能不正常，导致全身毛发增多，肾上腺分泌雄激素出现增多。
4、不孕：排卵障碍可能会导致女性不孕，不孕是指正常性生活并未采取避孕措施12个月后未妊娠，排卵障碍或稀发排卵约占女性不孕因素的40%。
5、卵巢功能低下：低雌激素引起的相应症状，如患者为40岁以上，无生育要求，可以不做特殊处理和治疗。