卵巢残余综合征多发生于困难的盆腔术后，临床表现较复杂，常见的典型症状包括盆腔疼痛、盆腔肿块。有时还可出现尿频、排便痛等肠道或泌尿道症状或性交痛、两胁不适或疼痛等表现。严重时可并发子宫内膜异位症和卵巢癌。
一、典型症状
1、盆腔疼痛：盆腔疼痛是最主要的症状，疼痛表现多种多样，可出现一侧或双侧下腹部周期性或持续性隐痛、刺痛、钝痛，或为间歇性，或进行性腹痛。腹痛轻重不一，轻者只有盆腔压迫感、下腹胀痛，严重者难以忍受。
2、盆腔肿块：约50%以上的病例有盆腔肿块，肿块来源于未被切除的卵巢皮质组织。
二、其他症状
1、肠道或泌尿道症状：少数患者可有排尿不适、尿频、排便痛，甚至有单侧输尿管梗阻、小肠梗阻等症状，往往是由于残余卵巢组织形成包块进而压迫相关脏器引起。
2、部分患者具有明显的性交疼痛或性交困难。
3、部分患者因输卵管受到侵犯，出现两胁不适或疼痛。
4、部分行双卵巢切除术时尚未绝经的患者，术后未行激素替代治疗的患者，体内残余卵巢组织持续分泌包括雌二醇在内的生物活性物质，故缺乏因雌激素撤除而产生的绝经后症状，如血管收缩症状、情绪改变、阴道干燥等。